Úterý 31. prosince 2013. - Vědci poprvé začali kombinovat výpočetní a genomické informace, aby předpovídali nová využití stávajících léků. Výpočtová studie financovaná Národními zdravotními ústavy (NIH) analyzovala genomická data a farmakologická data za účelem předpovídání nových užívání drog, která jsou již na trhu. Vědci, vedeni Dr. Atulem J. Butteem ze Stanfordské univerzity v Kalifornii, uvedli své výsledky ve dvou článcích v posledním vydání časopisu Science Translational Medicine. „Přijetí nového léku na trh obvykle stojí asi miliardu dolarů a mnoho let výzkumu a vývoje, “ říká Dr. Rochelle M. Long, ředitelka NIH Pharmagenomics Research Network, „pokud najdeme způsoby, jak znovu použít léky, které již schválené, stávající léčby by se mohly zlepšit a ušetřit čas a peníze. “
Vědci extrahovali svá data z Gene Expression Omnibus (z Národního centra pro biotechnologické informace), veřejné databáze obsahující výsledky tisíců genomických studií v různých oborech, prezentovaných vědci po celém světě.
Butteova skupina se zaměřila na 100 nemocí a 164 léků a vytvořila počítačový program pro vyhledávání tisíců možných kombinací léků a nemocí, léků a nemocí, jejichž vzorce genové exprese se navzájem rušily. Například, pokud nemoc zvyšuje aktivitu určitých genů, program se ji pokusí spojit s jedním nebo více léky, které tuto aktivitu snižují.
Mnoho kombinací lék-nemoc je známo a je v klinickém použití, což podporuje platnost tohoto přístupu. Například analýza správně předpověděla, že prednisolon může léčit Crohnovu chorobu, onemocnění, pro které je tento lék standardní terapií.
Další kombinace byly nové a překvapivé: lék k léčbě vředů (cimetidin) koincidovaný s rakovinou plic a antikonvulzivum (topiramát) koincidovalo se zánětlivým onemocněním střev - což zahrnuje Crohnovu chorobu.
Aby se potvrdil vztah cimetidinu s rakovinou plic, tým testoval tento lék na buňkách lidské rakoviny plic v laboratoři a v buňkách implantovaných do myší. V obou případech léčivo zpomalilo růst rakovinných buněk ve srovnání s kontrolní skupinou (buňky nebo myši), která nedostala cimetidin.
Aby se otestovalo, zda má antikonvulzivní topiramát účinek na zánětlivá střevní onemocnění, podali vědci lék potkanům, kteří měli příznaky takového střevního onemocnění: průjem, zánět, vředy a mikroskopické poškození tlustého střeva. Lék zmírnil všechny tyto příznaky, někdy dokonce lepší než prednisolon.
Vědci dále poznamenali, že v analýze byla seskupena nemoci s podobnými molekulárními procesy (například ty, které ovlivňují imunitní systém). Stejně jako léky s podobnými účinky (například ty, které zpomalují buněčné dělení). Vědci se domnívají, že studováním členů těchto neočekávaných uskupení se mohli dozvědět více o vývoji určitých nemocí a fungování některých léků na molekulární úrovni.
Podle Longa „je tento výzkum stále v rané fázi, ale je to slibná metoda pro kreativní, rychlý a cenově dostupný přístup, pokud jde o objevování nových způsobů použití drog, které již máme v našem terapeutickém arzenálu“.
Zdroj:
Tagy:
Psychologie Výživa Překontrolovat
Vědci extrahovali svá data z Gene Expression Omnibus (z Národního centra pro biotechnologické informace), veřejné databáze obsahující výsledky tisíců genomických studií v různých oborech, prezentovaných vědci po celém světě.
Butteova skupina se zaměřila na 100 nemocí a 164 léků a vytvořila počítačový program pro vyhledávání tisíců možných kombinací léků a nemocí, léků a nemocí, jejichž vzorce genové exprese se navzájem rušily. Například, pokud nemoc zvyšuje aktivitu určitých genů, program se ji pokusí spojit s jedním nebo více léky, které tuto aktivitu snižují.
Mnoho kombinací lék-nemoc je známo a je v klinickém použití, což podporuje platnost tohoto přístupu. Například analýza správně předpověděla, že prednisolon může léčit Crohnovu chorobu, onemocnění, pro které je tento lék standardní terapií.
Další kombinace byly nové a překvapivé: lék k léčbě vředů (cimetidin) koincidovaný s rakovinou plic a antikonvulzivum (topiramát) koincidovalo se zánětlivým onemocněním střev - což zahrnuje Crohnovu chorobu.
Aby se potvrdil vztah cimetidinu s rakovinou plic, tým testoval tento lék na buňkách lidské rakoviny plic v laboratoři a v buňkách implantovaných do myší. V obou případech léčivo zpomalilo růst rakovinných buněk ve srovnání s kontrolní skupinou (buňky nebo myši), která nedostala cimetidin.
Aby se otestovalo, zda má antikonvulzivní topiramát účinek na zánětlivá střevní onemocnění, podali vědci lék potkanům, kteří měli příznaky takového střevního onemocnění: průjem, zánět, vředy a mikroskopické poškození tlustého střeva. Lék zmírnil všechny tyto příznaky, někdy dokonce lepší než prednisolon.
Vědci dále poznamenali, že v analýze byla seskupena nemoci s podobnými molekulárními procesy (například ty, které ovlivňují imunitní systém). Stejně jako léky s podobnými účinky (například ty, které zpomalují buněčné dělení). Vědci se domnívají, že studováním členů těchto neočekávaných uskupení se mohli dozvědět více o vývoji určitých nemocí a fungování některých léků na molekulární úrovni.
Podle Longa „je tento výzkum stále v rané fázi, ale je to slibná metoda pro kreativní, rychlý a cenově dostupný přístup, pokud jde o objevování nových způsobů použití drog, které již máme v našem terapeutickém arzenálu“.
Zdroj: