V jádru každé buňky našeho těla jsou těsně složeny asi tři metry DNA, což umožňuje některým genům „exprimovat“ nebo aktivovat, vyjma jiných. Lékaři Tim Mercer a John Mattick z Garvanova institutu pro lékařský výzkum v Sydney a profesor John Stamatoyannopoulos z University of Washington v Seattlu analyzovali 3D strukturu genomu s vysokým rozlišením.
Geny jsou složeny z "exonů" a "intronů", přičemž první jsou sekvence, které kódují a exprimují proteiny, a poslední úseky nekódující DNA v médiu. Když jsou geny kopírovány nebo transkribovány, z DNA v RNA jsou intronové sekvence rozřezány nebo "sestřihnuty" a zbývající exony jsou zřetězeny dohromady za vzniku sekvence kódující protein. V závislosti na exonech, které jsou špízy, může stejný gen vytvářet různé proteiny.
Použitím velkého množství dat z projektu ENCODE Dr. Tim Mercer a jeho kolegové odvodili skládání genomu a zjistili, že i v rámci genu jsou vybrané exony snadno exponovány. „Představte si dlouhou a nesmírně komplikovanou révu, její zkroucené větve, které představují některé hrozny, které lze snadno roztrhnout, zatímco ostatní skryjí mimo jejich dosah, “ uvádí příklad. Mercer
„Současně si představte, že si líný sběratel ovoce jen sbírá hrozny na dosah ruky - dodává -. Stejný princip platí pro genom. Specifické geny a dokonce i specifické exony jsou na dosah skládání.“ V tomto smyslu tento vědec poukazuje na to, že v posledních letech vědci začali oceňovat, jak skládání genomu pomáhá určit, jak je vyjádřeno a regulováno.
„Tato studie poskytuje první známku toho, že trojrozměrná struktura genomu může ovlivnit sestřih genů. Můžeme z toho odvodit, že genom se skládá tak, že promotorová oblast, sekvence, která iniciuje transkripci genu, je našel vedle exonů a všechny jsou převezeny do přepisovacího zařízení, “zdůrazňuje.
"To podporuje nový způsob pohledu na věci, které se genom ohýbá kolem transkripčního aparátu, nikoli naopak. Ty geny, které přicházejí do styku s transkripčním aparátem, získají kopie, zatímco části, které obíhají daleko od dálky jsou ignorovány, “uzavírá tento výzkumník.
Zdroj: www.DiarioSalud.net
